Bioinformatica

Naast merkerontwikkeling, bieden wij ook diensten op het gebied van de novo genoomassemblage. Voor het assembleren van complexe genomen gebruiken we de Tulipa Julia assemblagesoftware ontwikkeld door onze partners Future Genomics Technologies en het Instituut voor Biologie van de Universiteit Leiden. Vergeleken met andere bekende assemblagesoftware is Tulipa Julia 50 keer sneller, waardoor hoge kwaliteit genoomassemblages kunnen worden geproduceerd op een snelle en kostenefficiënte manier. Voor elk geassembleerd genoom zullen we echter zoeken naar de beste hybride assemblagestrategie waarmee we de best mogelijke genoomassemblage kunnen leveren.

Naast genoomassemblages gebruiken we het NEBNEXT GS-genotyperingsplatform ontwikkeld door New England Biolabs om u te helpen met genotypering van hoge kwaliteit. Het voordeel van dit platform is dat het ook kan worden gebruikt voor kwantificering van alleldosering in polyploïde gewassen. Als u een bioinformatica-pijplijn nodig heeft om u te helpen bij uw dagelijkse werk, kunnen we deze samen met onze partner Future Genomics Technology voor u ontwikkelen.